XDJ-1000MK2 är den enda produkten i XDJ-serien som har jog-hjul i full storlek och erbjuder samma spårbläddringsfilter som erbjuds av 2000NXS2, vilket gör det möjligt för användare att snabbt och enkelt hitta spår efter BPM och tangent, såväl som spår som tidigare taggats under uppspelning med den nya matchningsfunktionen. Pekskärmen ger ett praktiskt QWERTY-sökalternativ för att underlätta navigeringen när du använder större spårdatabaser.

Pioneer har använt många av funktionerna som utvecklats för deras flaggskeppsmultiplayer när de skapade XDJ-1000MK2, inklusive förbättrad ljudåtergivning och en minskning av brus har uppnåtts genom att separera strömförsörjningskretsen för analogt ljud från den digitala kretsen. Förlustfria format stöds också av MK2 XDJ-1000 - med FLAC och ALAC som kombinerar MP3, AAC, WAV och AIFF som kodningsalternativ.

MK2 XDJ-1000 har också förbättrade prestandafunktioner inklusive MIDI-kontrollergränssnitt som tillåter anslutning av DDJ-SP1 för att underlätta taktil kontroll av en mängd funktioner inklusive hot cues, auto loopar och slip-läge – tack vare PRO DJ Link kan upp till 4 Pioneer XDJ-1000MK2 styras av en enda DDJ.

Utöver ovanstående funktioner erbjuder MK2 XDJ-1000 även DJ:s flerfärgade Wave Display och Wave Zoom, Memory Cues, Beat Jump en flerfärgad USB-port och MIDI/HID Control för användning med Rekordbox DJ.