Funktionerne i pro 3 er mange; 2x Analoge Oscillatorer (kendt fra Profeten 6 og OB-6), en Wavetable Oscillator (indeholdende 32x Wavetables med 16x Waveforms hver, inklusive Wave Morphing) og en Noise Generator danner grundlaget for en rig og fleksibel lyd. Sequential Pro 3 skinner med 3x valgbare analoge filterklassikere (Prophet 6, OB-6 og Moog) for at ændre den rige grundlyd. 2x Prophet 6- og Moog-filtrene er resonante og kan skelnes fra hinanden efter karakter. OB-6-filteret er et ægte tilstandsvariabelt filter og kan overtones kontinuerligt fra Low-Pass til Notch til High-Pass, eller alternativt kan Band-Pass aktiveres. Det valgte filter er yderligere forbedret med sin egen Drive-parameter. Signalstien inkluderer også en dobbelt effektblok, der genererer Delay, Reverb, Chorus og Phaser. Derudover tilbyder Sequential Pro 3 en mere kraftfuld analog forvrængning og en afstembar feedback-linje.

Ikke færre end 3x synkroniserbare LFO'er, hver med 5x Waveforms og 4x loopable Envelopes, giver lydene i Sequential Pro 3 en ubestridelig bevægelse. Takket være den omfattende modulationsmatrix med 32x indgange kan LFO'er, Envelopes, Touch-Strip, Sequencer og forskellige controllere tildeles næsten enhver parameter. Dette gør det muligt for Pro 3 at have en fast signalsti, men stadig give den form for moduleringsfleksibilitet, som du ellers kun ville finde i et modulært system. Selvfølgelig er der også en Sequencer med 16x spor ombord, som kan automatisere ikke kun noder, men også alle parametre. Du kan også gemme 4x mønstre pr. lyd, eller oprette et længere med op til 64x trin. Forskellige afspilningsretninger og triggertilstande fuldender værktøjssættet til Sequential Pro 3.